L1402/3 SNP Tree
L1403   Z16266                                                                                                                                                                                              
Z16264   BY3381                                                                                                                                                                                              
Z16265                                                                                                                                                                                                  
                                                       
A5409   A5410   13677368               L1402   Z16834   Z16837   Z16840   Z16843                                                                                                                                                      
        A385   Z16835   Z16838   Z16841                                                                                                                                                          
BY3455   BY4116   BY4123             Z16833   Z16836   Z16839   Z16842   A819   DYS561=14                                                                                                                                                  
BY4117   BY4119   BY4127                                                                                                                                                                                    
        A818   FGC23104   FGC58676(I)*                                                                                                                                                              
A418   F4092   BY4121   BY4128 6674404                                            
A419   BY3457   BY4122   BY4129 7664002     FGC45380*   FGC45381*   FGC45383*   FGC45389*   FGC45398*   FGC58670*                                 A423 (Moore) A1159/FGC23107   FGC23105   FGC23111 A426   (Doolin, Kelly, Lawler, Phelan)                                                                
BY3454   BY4114   PF1052   BY4130 7683752                                               A424   A1160/FGC23109   FGC23110   FGC23119 A728   Z17694                                                                    
BY4115   BY4118   BY4124   BY4131 7683754     A459   A682   (Scottish Lines) DYS385=11,13 DYS570=15   FGC45382*   FGC45384*   FGC45399*,     A421   A775   (Manx Lines)                                                                
6946276   BY4120   BY4126     8295302                                     FGC23106   FGC23113   FGC23118     A1344/FGC28341           A12131                 ZS2228                            
              8467080     FGC20957?   DYS533=12, DYS 714=25, DYS715=23     FGC45397             A420   DYS439=10 FGC32535   FGC32540   FGC23112   FGC23114         A1343(I)                                 14208509(I)                          
BY4132   BY4134         8793161                 A773(I)   A776 FGC32537   FGC32543                                                        
BY4133             9859970     A422 (Down/Antrim/Glasgow) A741 (N. Antrim/L. Lomond)     DYS442=10 FGC45390   FGC45392   14838762(I) (Isle of Man)   A777(I) FGC32539       FGC23103         A425           6238372 A7493                                        
              15363788     A774     FGC20955   FGC20960       FGC45400(I)*                     FGC23115                 6267917                                          
BY3517(I)   R Viar   P E Viar D Moore 15973858 R Gillespie Dowling       FGC20957   DYS710=34.2                         FGC23116 D G Moore K Moore R Moore FGC28340 A10219  R C Smith Smith Lewis 22422177     Kelly Phelan Rowan Darst Lawler W R Smith Bassett Kitchen Devoy Hoban Devine Philips Mahon Kitchen Lollar
  J Viar   157389   156939 358527 17179906 282809 N127012 B Morrison J Morrison         C McNeil McEldowney FGC45394 Downing G Morrison R Morrison Johnson   Z. Lewis J Kewley FGC23117 178605 148439 200445 Doolin 8793966 128247 173897 Kelley A7495       204897 212914 357761 291311 N81021 11848 5789 201059 237627 359286 238924 N62146 71888 193185 207303
42087       YSEQ 1506  17203983     102866 146318 A740 DYS447=26   McMorris 207143 518391 Downey 161348 282328 78417 114270   B131873 188545 25430112 YSEQ 741 YSEQ 742 YSEQ 1052 45131 18705505     205429               YSEQ 1624   YSEQ 955   YSEQ 1634         YSEQ 4447    
YSEQ 781   9419249   M269+ 14429102(I) 18137993 Z16265+ L1403+ YSEQ 976 YSEQ 952 (N. Antrim)     86241 YSEQ 972   N125150   YSEQ 780 YSEQ 950       YSEQ 1258 D R Moore L1402/3 Pkg L1403+ L1402+ FGC28339 M Dowling   A1344+ A712 19093923 Kelley Kelly A426+ A1161 7810718 A426+ A425- A426+ L1402/3 Pkg A9071 L1402+ 2724873 A818+ L1402+ A819+ L1402+ L1402+
15823518(I) 25108897       23619746 Z16266+   14253255(I) FGC20568   W Morrison FGC71882 A459+ FGC58671 14629525 DF5+ A772 L1402/3 Pkg FGC32536 11329555 FGC33438 122847   Complete,     18890563(I) 386434     A713 Kelly 184136 114197   A1162 7944903   A712-     Complete 13273432 A421- 9386241 A421- A818- A385+ A818+  
15811002       Z22771 6753346   L1402/3 Pkg 14492173 A742 165965 FGC71883 A682+ FGC58673 19790727   A778   Complete FGC32538 11329556 FGC33439 FGC23108 L1402+             23450238 639611       8520696 14782876   A713-   A8692 17332068 A423- 15753570 A423- 6767666 DC405    
24600509(I)       Holmes Private      Complete 26649624 (PA/SC/IL) YSEQ 1412 FGC71884 FGC45397+ FGC58675 20301035   FGC21557 A682- FGC32541 16057009 FGC33441 FGC23120 A712-             23508030 19021728 A7494 A1368 Kelly 15302858 16922697   A1161-   A8693 17624165 A424- 17935007 A424- 6938265 FGC32825    
L1402/3 Pkg       N63514   variants     12514258 FGC20959 A740+ FGC71885 FGC45390- FGC58918   Downing FGC21558 A423- FGC32542 20298178 FGC33442 11556337 A713-               22574759 A7495 A1369 204897 16901249 28733582   A1162-   FGC19347 19066839 A426- 17945957 A426- 8090647 Z8252    
  Complete       BY3455+       20285004   A742- FGC71886 FGC45392- FGC58669   42695 20347450 A712- FGC32544 22460064 FGC33444 20285004 A1343-               21231293 19212369 A1370 A426+ 18102496 21929080   A1343(I)-   13681141 23081122 A459- 18043250 A459- 8613451 6857203    
      Private       L1402/3 Pkg M Morrison FGC71887 L1402/3 Pkg FGC58672   DF5+ L1402/3 Pkg A772- FGC32849   FGC33445 K Moore A1344- S Moore F Moore B T Dowling M B Dowling Dolan Pedigo 17652519 22444637 6826623   22563492 A1344-   14353814 23366926 FGC23118- 21469947   14752854 8589878  
P R Viar K Moore R K Moore  variants R A Gillespie James (Ross)     Complete 26384 FGC71888   Complete FGC58674 Downing     Complete A778- 17951172(I)   FGC33446 YSEQ 2948 A1369- 148440 271544 530771 386433 202200 N173465 17660631 22478167 9868131   22918482 A1369- Pemberton 14453027 6789307 FGC23119- 23207585 Devine 16202646 16377814 Kitchen
173166 264171 265119 Murphy 220753 102858 I Morrison YSEQ 643 Reynolds McAdams 187591   A682- FGC21557-     19134848(I)   A1370- YSEQ 707 YSEQ 956         22465346 24729697? 16211348 Kelley 22932387 A1370- 345428 16185686 8319412 8729834 22486615 44283 16845745 21568904 173557
M269+ DF5+ 14951829 N129469     YSEQ 11761 L1402/3 Pkg 496411 72177 YSEQ 1168       L1402/3 Pkg     L1402/3 Pkg L1402/3 Pkg 15051079 A10218 A7112 8238979 Hargreaves 17364608 193030 CTS1807   A426+ 16402461 8551863 14235635 22271183 L21+ 17212637 21737418 M269+
  BY3454+ 15097579 BY3455+     A459+   Complete A459+ A459+ FGC45385         Complete     Complete   Complete 6705852   A7113 23317385 (Devine) A459-     18635163 8737136 14439740     18655371 23034500  
D Viar     Private     A422+ R Morrison DYS710=34.2   FGC45386                   FGC42097 17179175 B3533 A426+ Viljoen   19057120 15600557(I) 14593368 Hamilton   21115371 23073111  
178990      variants Coogan   A740- YSEQ 11219     FGC45387       Ferguson         FGC42098 17105125(I) 14096207   257808   21353683 A9038 16934830 176000   21780602 23456330  
M269+       512163     A18710     FGC45393     Private         FGC42099 15456909 13658980 Kelly A426+   21463630 22437144 17353595 13670361   22866163 24455853  
                    FGC45395 Variants         FGC42100     482932 8102751   2817602 22480476 17599776 20309744   23594723 24365171(I)  
S H Viar     H Morrison           FGC42101 A426+ 9141283 8887458 22480497 18064294 8044497 23891212 7457572
208729 31198 FGC42102   7399315 8067972(I) 18366147(I) 23483611 8133009 24519384 22466154
BY4130   A459+ 18234552(I)   9847582 22467590 22480491(I) 23976420 8749305 6945758(I) 22466177
      Kelley 13907799   19270004(I)   9733289 22466182
Bradshaw   * The above SNPs may not be private within L1402. 266248 18251640 Bassett 22461840     22466187
493462   A426+ 16393308 126089 Philips 22466239
      18246357 L1402+ 1151199 22466261
      22571425   M269+   Edwin Holcombe 
Kelley 22682425       efholcombe@mindspring.com
135666 17584544       Updated 1/20/2018
M269+ 22272256      
  22314732       Key to SNPs
22464752     6767666 Sanger-tested
    6767666 NGS-report only
Philips   6767666(I) INDEL
71714   6767666 Reliability?
M269+   6767666 Sanger-untestable
    6767666 HG38 results